Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWA1

PPP1R15B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 15B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R15BQ5SWA1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP1R15BQ5SWA1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R15BQ5SWA1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms