Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEP78Q5JTW2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP78Q5JTW2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP78Q5JTW2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP78Q5JTW2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP78Q5JTW2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEP78Q5JTW2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms