Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FGD3Q5JSP0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms