Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9I0

TFDP3, Transcription factor Dp family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFDP3Q5H9I0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFDP3Q5H9I0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFDP3Q5H9I0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms