Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB6CQ53S08 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB6CQ53S08 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms