Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUSP28Q4G0W2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms