Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC57Q2TAC2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC57Q2TAC2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC57Q2TAC2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC57Q2TAC2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC57Q2TAC2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC57Q2TAC2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC57Q2TAC2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC57Q2TAC2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC57Q2TAC2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC57Q2TAC2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC57Q2TAC2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC57Q2TAC2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC57Q2TAC2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC57Q2TAC2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC57Q2TAC2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC57Q2TAC2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC57Q2TAC2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC57Q2TAC2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC57Q2TAC2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC57Q2TAC2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC57Q2TAC2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms