Protein–RNA interactions for Protein: Q1L5Z9

LONRF2, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 2, humanhuman

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Length 754 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF2Q1L5Z9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LONRF2Q1L5Z9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF2Q1L5Z9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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