Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LONRF1Q17RB8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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LONRF1Q17RB8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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