Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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