Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCSK7Q16549 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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