Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPEGQ15772 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPEGQ15772 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms