Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUM3Q15397 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
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