Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCOLCEQ15113 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCOLCEQ15113 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms