Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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