Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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