Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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