Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKP1Q13835 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PKP1Q13835 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
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