Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF5Q13568 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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