Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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NAE1Q13564 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
NAE1Q13564 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NAE1Q13564 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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