Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ERCC8Q13216 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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ERCC8Q13216 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ERCC8Q13216 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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ERCC8Q13216 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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ERCC8Q13216 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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ERCC8Q13216 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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ERCC8Q13216 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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