Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL28Q13084 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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