Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms