Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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TP53BP1Q12888 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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TP53BP1Q12888 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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TP53BP1Q12888 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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TP53BP1Q12888 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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TP53BP1Q12888 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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TP53BP1Q12888 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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TP53BP1Q12888 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TP53BP1Q12888 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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