Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBRQ0VD83 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBRQ0VD83 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms