Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD300CQ08708 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms