Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAD51Q06609 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms