Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC18A2Q05940 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms