Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNT1Q02742 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms