Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NHLH2Q02577 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms