Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC10Q01780 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms