Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1DQ01668 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms