Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms