Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK17Q00537 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms