Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRPS9P82933 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPS9P82933 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms