Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRX6P78412 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRX6P78412 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRX6P78412 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRX6P78412 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRX6P78412 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX6P78412 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX6P78412 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX6P78412 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX6P78412 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX6P78412 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX6P78412 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX6P78412 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX6P78412 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX6P78412 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX6P78412 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRX6P78412 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRX6P78412 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRX6P78412 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRX6P78412 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRX6P78412 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRX6P78412 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRX6P78412 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRX6P78412 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRX6P78412 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRX6P78412 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRX6P78412 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRX6P78412 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
IRX6P78412 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRX6P78412 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRX6P78412 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
IRX6P78412 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRX6P78412 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRX6P78412 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRX6P78412 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRX6P78412 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
IRX6P78412 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRX6P78412 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRX6P78412 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRX6P78412 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRX6P78412 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IRX6P78412 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IRX6P78412 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IRX6P78412 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRX6P78412 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRX6P78412 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRX6P78412 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
IRX6P78412 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRX6P78412 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRX6P78412 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRX6P78412 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRX6P78412 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRX6P78412 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRX6P78412 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRX6P78412 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRX6P78412 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRX6P78412 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRX6P78412 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRX6P78412 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRX6P78412 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRX6P78412 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRX6P78412 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRX6P78412 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRX6P78412 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRX6P78412 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRX6P78412 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRX6P78412 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRX6P78412 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRX6P78412 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX6P78412 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX6P78412 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX6P78412 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX6P78412 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX6P78412 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX6P78412 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX6P78412 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX6P78412 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX6P78412 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX6P78412 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX6P78412 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX6P78412 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX6P78412 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX6P78412 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX6P78412 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX6P78412 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX6P78412 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX6P78412 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX6P78412 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX6P78412 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX6P78412 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX6P78412 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX6P78412 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX6P78412 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX6P78412 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX6P78412 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX6P78412 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRX6P78412 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRX6P78412 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRX6P78412 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRX6P78412 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms