Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms