Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL11P62913 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL11P62913 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPL11P62913 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL11P62913 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL11P62913 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL11P62913 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL11P62913 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL11P62913 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL11P62913 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL11P62913 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL11P62913 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL11P62913 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms