Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERV-K104P61576 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERV-K104P61576 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERV-K104P61576 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERV-K104P61576 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERV-K104P61576 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERV-K104P61576 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERV-K104P61576 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERV-K104P61576 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERV-K104P61576 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERV-K104P61576 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERV-K104P61576 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERV-K104P61576 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERV-K104P61576 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERV-K104P61576 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERV-K104P61576 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERV-K104P61576 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERV-K104P61576 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERV-K104P61576 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERV-K104P61576 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms