Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4BP61018 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4BP61018 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms