Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX16P57768 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX16P57768 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX16P57768 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX16P57768 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX16P57768 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX16P57768 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX16P57768 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX16P57768 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX16P57768 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX16P57768 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX16P57768 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX16P57768 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX16P57768 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX16P57768 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX16P57768 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX16P57768 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX16P57768 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNX16P57768 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNX16P57768 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX16P57768 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX16P57768 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX16P57768 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX16P57768 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX16P57768 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX16P57768 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX16P57768 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX16P57768 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX16P57768 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX16P57768 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX16P57768 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX16P57768 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX16P57768 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX16P57768 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX16P57768 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX16P57768 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX16P57768 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX16P57768 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX16P57768 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX16P57768 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX16P57768 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX16P57768 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX16P57768 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX16P57768 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX16P57768 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX16P57768 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX16P57768 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX16P57768 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX16P57768 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX16P57768 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX16P57768 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX16P57768 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX16P57768 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX16P57768 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX16P57768 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX16P57768 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX16P57768 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX16P57768 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX16P57768 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX16P57768 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX16P57768 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX16P57768 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX16P57768 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX16P57768 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX16P57768 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX16P57768 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX16P57768 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX16P57768 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX16P57768 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX16P57768 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX16P57768 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX16P57768 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX16P57768 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX16P57768 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX16P57768 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX16P57768 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX16P57768 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX16P57768 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX16P57768 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX16P57768 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX16P57768 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX16P57768 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX16P57768 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX16P57768 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX16P57768 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX16P57768 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX16P57768 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX16P57768 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX16P57768 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX16P57768 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX16P57768 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX16P57768 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX16P57768 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX16P57768 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX16P57768 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX16P57768 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX16P57768 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX16P57768 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX16P57768 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX16P57768 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms