Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BACE1P56817 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BACE1P56817 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BACE1P56817 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BACE1P56817 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BACE1P56817 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BACE1P56817 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BACE1P56817 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BACE1P56817 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BACE1P56817 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BACE1P56817 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BACE1P56817 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BACE1P56817 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BACE1P56817 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BACE1P56817 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BACE1P56817 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BACE1P56817 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BACE1P56817 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BACE1P56817 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BACE1P56817 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BACE1P56817 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BACE1P56817 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BACE1P56817 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BACE1P56817 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BACE1P56817 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BACE1P56817 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BACE1P56817 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BACE1P56817 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BACE1P56817 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BACE1P56817 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BACE1P56817 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BACE1P56817 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BACE1P56817 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BACE1P56817 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BACE1P56817 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BACE1P56817 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BACE1P56817 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BACE1P56817 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BACE1P56817 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BACE1P56817 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BACE1P56817 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BACE1P56817 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BACE1P56817 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BACE1P56817 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BACE1P56817 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BACE1P56817 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BACE1P56817 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BACE1P56817 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BACE1P56817 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BACE1P56817 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BACE1P56817 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BACE1P56817 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BACE1P56817 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BACE1P56817 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BACE1P56817 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BACE1P56817 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BACE1P56817 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BACE1P56817 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BACE1P56817 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BACE1P56817 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BACE1P56817 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BACE1P56817 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BACE1P56817 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BACE1P56817 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BACE1P56817 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BACE1P56817 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BACE1P56817 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BACE1P56817 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BACE1P56817 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BACE1P56817 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BACE1P56817 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BACE1P56817 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BACE1P56817 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BACE1P56817 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BACE1P56817 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BACE1P56817 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BACE1P56817 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BACE1P56817 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BACE1P56817 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BACE1P56817 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BACE1P56817 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BACE1P56817 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BACE1P56817 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BACE1P56817 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BACE1P56817 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BACE1P56817 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BACE1P56817 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BACE1P56817 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BACE1P56817 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BACE1P56817 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BACE1P56817 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BACE1P56817 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BACE1P56817 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BACE1P56817 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BACE1P56817 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BACE1P56817 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BACE1P56817 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BACE1P56817 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BACE1P56817 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BACE1P56817 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms