Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2KP53803 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms