Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LUMP51884 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LUMP51884 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LUMP51884 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LUMP51884 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LUMP51884 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LUMP51884 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LUMP51884 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LUMP51884 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LUMP51884 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LUMP51884 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LUMP51884 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LUMP51884 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LUMP51884 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LUMP51884 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LUMP51884 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LUMP51884 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LUMP51884 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LUMP51884 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LUMP51884 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LUMP51884 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LUMP51884 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LUMP51884 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LUMP51884 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LUMP51884 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LUMP51884 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LUMP51884 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LUMP51884 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LUMP51884 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LUMP51884 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LUMP51884 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LUMP51884 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LUMP51884 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LUMP51884 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LUMP51884 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LUMP51884 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LUMP51884 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LUMP51884 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LUMP51884 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LUMP51884 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LUMP51884 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LUMP51884 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LUMP51884 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LUMP51884 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LUMP51884 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LUMP51884 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LUMP51884 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LUMP51884 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LUMP51884 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LUMP51884 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LUMP51884 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LUMP51884 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LUMP51884 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LUMP51884 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LUMP51884 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LUMP51884 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LUMP51884 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LUMP51884 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LUMP51884 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LUMP51884 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LUMP51884 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LUMP51884 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LUMP51884 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LUMP51884 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LUMP51884 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LUMP51884 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LUMP51884 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LUMP51884 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LUMP51884 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LUMP51884 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LUMP51884 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms