Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms