Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN3P51790 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN3P51790 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms