Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSEN1P49768 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms