Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS1P48651 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms