Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RPL28P46779 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RPL28P46779 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RPL28P46779 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RPL28P46779 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RPL28P46779 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RPL28P46779 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RPL28P46779 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RPL28P46779 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RPL28P46779 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RPL28P46779 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
RPL28P46779 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RPL28P46779 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RPL28P46779 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RPL28P46779 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RPL28P46779 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RPL28P46779 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RPL28P46779 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RPL28P46779 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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RPL28P46779 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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RPL28P46779 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL28P46779 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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RPL28P46779 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL28P46779 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL28P46779 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL28P46779 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL28P46779 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL28P46779 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL28P46779 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RPL28P46779 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL28P46779 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL28P46779 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL28P46779 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL28P46779 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL28P46779 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL28P46779 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL28P46779 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RPL28P46779 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL28P46779 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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RPL28P46779 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL28P46779 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL28P46779 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL28P46779 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL28P46779 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL28P46779 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL28P46779 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL28P46779 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL28P46779 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL28P46779 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL28P46779 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL28P46779 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL28P46779 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL28P46779 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL28P46779 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL28P46779 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL28P46779 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL28P46779 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL28P46779 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL28P46779 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPL28P46779 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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