Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms